夫医道所兴，其来久矣。上古神农始尝草木而知百药，黄帝咨访岐伯、伯高、少俞之徒，内考五脏六腑，外综经络血气色候，参之天地，验之人物，本性命，穷神极变，而针道生焉。其论至妙，雷公受业，传之于后。伊尹以亚圣之才，撰用《神农本草》以为汤液。中古名医有俞跗、医缓、扁鹊，秦有医和，汉有仓公，其论皆经理识本，非徒诊病而已。
近代太医令王叔和，撰次仲景选论甚精，指事施用。按《七略》《艺文志》：《黄帝内经》十八卷，今有《针经》九卷、《素问》九卷，二九十八卷，即《内经》也，亦有所亡失。又有《明堂孔穴针灸治要》，皆黄帝岐伯遗事也。三部同归，文多重复，错互非一。
卷一：精神五脏论、五脏变、五脏六腑阴阳表里、五脏六腑官、五脏大小六腑应候、十二原、十二经水、四海、气息周身五十营、营气、营卫三焦、阴阳清浊精气津液血脉、津液五别、奇邪血络、五色、阴阳二十五人形性血气不同。
卷二：十二经脉络脉支别（上下）、奇经八脉、脉度、十二经标本、经脉根结、经筋、骨度肠度肠胃所受。
卷三：诸穴总计六百五十四穴（单四十八穴、双三百零八穴）。头面颈肩胸腹背分部三十五篇：头直鼻中发际傍行至头维七穴、督脉风府八穴、侠督脉玉枕十穴、目上脑空十穴、耳上完骨十二穴、背第一椎至脊十一穴、侠脊一寸五分四十二穴、侠脊三寸二十六穴、面二十九穴、耳前后二十穴、颈十七穴、肩二十八穴、胸天突七穴、输府十二穴、气户十二穴、云门十二穴、腋胁八穴、腹鸠尾十五穴、幽门二十一穴、不容二十三穴、期门十四穴、章门十二穴、手太阴十八穴、手厥阴十六穴、手少阴十六穴、手阳明二十八穴、手少阳二十四穴、手太阳十六穴、足太阴二十二穴、足厥阴二十二穴、足少阴二十穴、足阳明三十穴、足少阳二十八穴、足太阳三十四穴。
卷四：经脉（上中下）、病形脉诊（上下）、三部九候。
卷五：针灸禁忌（上下）、九针九变十二节五刺五邪、缪刺、针道、针道终始、针道自然逆顺、针道外揣纵舍。
卷六：八正八虚八风大论、逆顺病本末方宜形志大论、五脏六腑虚实大论、阴阳清浊顺治逆乱大论、四时贼风邪气大论、内外形诊老壮肥瘦病旦慧夜甚大论、阴阳大论、正邪袭内生梦大论、五味所宜五脏生病大论、五脏传病大论、寿夭形诊病候耐痛不耐痛大论、形气盛衰大论。
卷七：六经受病发伤寒热病（上中下）、足阳明脉病发热狂走、阴衰发热厥阳衰发寒厥、太阳中风感于寒湿发痓、阴阳相移发三疟。
卷八：五脏传病发寒热（上下）、经络受病入肠胃五脏积发伏梁息贲肥气痞气奔豚、五脏六腑胀、水肤胀鼓胀肠覃石瘕、肾风发风水面肿。
卷九：大寒内薄骨髓阳逆发头痛、寒气客于五脏六腑发卒心痛胸痹心疝三虫、邪在肺发咳逆上气、肝受病发胸胁满痛、邪在心胆发悲恐太息口苦不乐及惊、脾受病发四肢不用、脾胃大肠受病发腹胀满肠中鸣短气、肾小肠受病发腹胀腰痛引背少腹控睾、三焦膀胱受病发少腹肿不得小便、三焦约内闭发不得大小便、足厥阴脉动喜怒不时发疝遗溺癃、足太阳脉动发下部痔脱肛。
卷十：阴受病发痹（上下）、阳受病发风（上下）、八虚受病发拘挛。
卷十一：寒气客于经络发卒心痛等、五脏气绝、热病五十九刺等（厥、痿、疟、消渴、黄胆、水胀、痈疽诸篇）。
卷十二：妇人杂病、小儿杂病诸篇。